顯微鏡的的目鏡和物鏡在未使用前室沒有安裝的，因此，每次使用顯微鏡前，先要目鏡和物鏡安裝上去。顯微鏡目鏡的安裝并不難，關鍵是安裝顯微鏡的物鏡，確保物鏡安裝的正確。由于物鏡價格昂貴，為確保安全，建議在安裝顯微鏡物鏡時要用左手食指和中指托住，然后用右手將物鏡裝上去，這樣即使沒安裝好，也不會摔到地上。
顯微鏡測微尺由于不同顯微鏡及附件的放大倍數不同，因此校正目鏡測微尺必須針對特定的顯微鏡和附件(特定的物鏡、目鏡、鏡筒長度)進行，而且只能在特定的情況下重復使用，當更換不同放大倍數的目鏡或物鏡時，必須重新校正目鏡測微尺每一格所代表的長度。校正方法如下:
把目鏡的上透鏡旋下，將目鏡測微尺的刻度朝下輕輕地裝入目鏡的隔板上，把鏡臺測微尺置于載物臺上，刻度朝上。先用低倍鏡觀察，對準焦距，視野中看清鏡臺測微尺的刻度后，轉動目鏡，使目鏡測微尺與鏡臺測微尺的刻度平行，移動推動器，使兩尺重疊，再使兩尺的“0"刻度*重合，定位后，仔細尋找兩尺第二個*重合的刻度，計數兩重合刻度之間目鏡測微尺的格數和鏡臺測微尺的格數。因為鏡臺測微尺的刻度每格長l0μm，所以由下列公式可以算出目鏡測微尺每格所代表的長度。例如目鏡測微尺5小格正好與鏡臺測微尺5小格重疊，已知鏡臺測微尺每小格為l0μm，則目鏡測微尺上每小格長度為=5×10μm/5=10μm用同法分別校正在高倍鏡下和油鏡下目鏡測微尺每小格所代表的長度。
